Cini Boeri si è laureata al Politecnico di Milano nel 1951 e dopo un breve stage nello studio di Giò Ponti, inizia una lunga collaborazione con Marco Zanuso.  Dal 1963 intraprende la propria attività professionale occupandosi di architettura civile e disegno industriale.

In Italia e all'estero si è occupata di case unifamiliari, appartamenti, allestimenti museali, uffici, negozi, dedicando grande attenzione allo studio della funzionalità dello spazio e ai rapporti psicologici tra l'uomo e l'ambiente. Nell'ambito del disegno industriale si è occupata in modo particolare del progetto di elementi per l'arredo e componenti per l'edilizia: diverse sue realizzazioni sono presenti in musei ed esposizioni internazionali.

Presso diverse università e istituzioni in Italia e all'estero ha tenuto numerose conferenze, in particolare a Berkeley, Barcellona, al Nucleo del Deseno Industrial di Sao Paulo, al Collegio degli Architetti di Rio de Janeiro, alla Cranbrook School di Detroit, alla Southern California Institute of Architecture di Vico Marcote (CH), al Pacific Design Center e alla UCLA di Los Angeles, all'Accademia di Architettura di Mendrisio e all'Università della Svizzera Italiana.

Ha svolto, presso la facoltà di Architettura del Politecnico di Milano, corsi di progettazione architettonica e di disegno industriale e arredamento.

Cini Boeri è stata nominata Socio Onorario ADI nel 2012 ed è anche membro del Consiglio di Amministrazione della XVI Triennale di Milano, ha partecipato a numerose giurie di concorsi internazionali e ricevuto numerosi premi internazionali.